Sete crianças estão num acampamento de verão quando, inesperadamente, uns estranhos aparelhos caem do céu - os
digivices (
digital devices ou dispositivos digitais) e elas são transportadas para o
Mundo Digital (
Digimundo), mais propriamente para uma ilha conhecida como Ilha Arquivo. Cada uma das crianças conhece um
digimon que se torna seu companheiro. Para tentarem regressar a casa, as crianças percebem que existem
digimons bons e
digimons maus. Eles iniciam uma luta contra os inimigos que pretendem dominar o
Mundo Digital com a força da Escuridão, contando com a ajuda dos seus
digimons que, com o passar do tempo, se tornam mais poderosos e conseguem se converter em criaturas maiores e mais fortes.
Depois da derrota do temível
Devimon, eles conhecem
Gennai, um velho digi-humano que se torna seu mentor.
Gennai informa-os que eles são as lendárias Crianças Escolhidas, e que estão ali para salvar o
Mundo Digital e o Mundo Real do poder da Escuridão. As Crianças atravessam o oceano em direção a um novo continente, onde enfrentarão ameaças ainda mais perigosas.
Mais tarde, cada um deles recebe um Símbolo/Brasões dos
Digiescolhidos. Cada Símbolo é o espelho da maior virtude de cada uma das crianças -
Coragem(Tai),
Amizade(Matt),
Amor (Sora),
Esperança (T.K.),
Confiança (
Honestidade , no original) (Joe),
Sabedoria (Izzy),
Luz (Kari) e
Sinceridade (Mimi). Para que um Símbolo brilhe e ative o seu poder, é necessário que o seu portador exiba a característica que ele representa. Desta forma, possibilita aos
digimons atingir o nível Perfeito. Alguns dos Escolhidos são confrontados com dúvidas por não se acharem merecedores do seu Símbolo, mas com o passar do tempo e com a ajuda dos
digimons, todos eles provam ser dignos dos Símbolos.
Ao enfrentarem inimigos cada vez mais poderosos, eles descobrem que não conseguirão cumprir a missão sem a Oitava Criança Escolhida. Todos juntos viajam para o Mundo Real, onde travam uma luta contra o tempo tentando encontrá-la antes do terrível
Myotismon, que aterroriza
Odaiba inteira com o objetivo de a matar. A Oitava Criança revela-se,
Kari, e com a sua ajuda conseguem derrotar definitivamente
VenomMyotismon (pensavam eles...
VenomMyotismon volta na segunda temporada na forma de
Malomyotismon ). Porém, há um grande desequilíbrio entre os dois Mundos e eles são obrigados a regressar ao Mundo Digital para enfrentarem os térríveis
Mestres das Trevas.
Depois de resolverem os seus problemas e reunírem um grande exército com todos os amigos que conheceram, os quatro mestres -
Piedmon,
MetalSeadramon,
Pinochimon e
Mugendramon - são derrotados e dá-se a batalha final contra
Apocalymon. Quando tudo parece perdido, a união das crianças vence finalmente a Escuridão.
Assim, o Mundo Digital foi salvo e as Crianças Escolhidas regressam a casa, prometendo voltar.